Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VimP20152 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VimP20152 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VimP20152 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VimP20152 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VimP20152 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VimP20152 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VimP20152 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VimP20152 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VimP20152 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VimP20152 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VimP20152 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VimP20152 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VimP20152 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VimP20152 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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