Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms