Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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