Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms