Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18530 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18530 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms