Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pou4f1P17208 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms