Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms