Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Myod1P10085 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms