Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms