Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf1P09925 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms