Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LtaP09225 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtaP09225 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtaP09225 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms