Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms