Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PdgfrbP05622 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PdgfrbP05622 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PdgfrbP05622 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PdgfrbP05622 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfrbP05622 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfrbP05622 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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