Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P04213 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P04213 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P04213 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P04213 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P04213 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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P04213 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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P04213 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P04213 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms