Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AfpP02772 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AfpP02772 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AfpP02772 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AfpP02772 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AfpP02772 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AfpP02772 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AfpP02772 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AfpP02772 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AfpP02772 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AfpP02772 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AfpP02772 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms