Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BlmO88700 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BlmO88700 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BlmO88700 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BlmO88700 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BlmO88700 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BlmO88700 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms