Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

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Length 635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc6a20bO88575 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc6a20bO88575 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc6a20bO88575 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc6a20bO88575 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc6a20bO88575 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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