Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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