Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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