Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms