Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Length 4,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TnxbO35452 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TnxbO35452 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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TnxbO35452 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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TnxbO35452 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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TnxbO35452 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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TnxbO35452 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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TnxbO35452 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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TnxbO35452 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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