Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms