Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CenpaO35216 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms