Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AlyrefO08583 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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