Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms