Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm5849J3QPE5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm5849J3QPE5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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