Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms