Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28051J3QMA2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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