Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp408H7BX78 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp408H7BX78 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms