Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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