Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XntrpcF8VQM8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XntrpcF8VQM8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms