Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms