Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5861F6VCN9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5861F6VCN9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms