Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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