Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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