Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3250E9Q1M3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms