Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
2610021A01RikE9Q0Q3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms