Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms