Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4931429L15RikE9PVU2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms