Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms