Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan18E9PUD6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms