Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms