Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms