Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf217D3YYI7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms