Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms