Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms