Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms