Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms