Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zbed5B2RPU8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms