Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms